DU外科治疗的适应证主要有两类：第Ⅰ类：发生严重并发症的DU，如急性穿孔、大出血和瘢痕性幽门梗阻；第Ⅱ类：内科治疗无效或某些特殊类型的溃疡。
1．急性穿孔一般是指急性游离穿孔，出现下列情况须采取手术治疗：①饱食后穿孔；②腹腔渗液较多，就诊时间较晚，发生局限或弥漫性化脓性腹膜炎；③一般情况欠佳或有休克表现；④溃疡病史较长，有顽固性疼痛且发作频繁；⑤伴有幽门梗阻、出血等并发症；⑥保守治疗效果不佳。
2．大出血若溃疡病并大出血已经确诊，一般先行内科治疗，出现下列情况应考虑外科手术治疗：①出血迅猛，情况危急，出血后不久即发生休克者；②6-8小时内输血600ml-900ml，生命体征不见好转或虽一度好转，但停止输血或输血速度减慢后，又迅速恶化，或在24小时内需输血1000ml以上才能维持血压者；③内科治疗出血不止，或暂时止住出血，不久又复发者；④年龄大于60岁，血管硬化，估计难以止血者；⑤同时有溃疡穿孔或幽门梗阻者；⑥胃镜检查见活动性大出血，而内科治疗无效者。
3．幽门梗阻一旦诊断为瘢痕性幽门梗阻，应在充分做好术前准备后进行手术治疗。
4.内科治疗无效或某些特殊类型的溃疡内科治疗无效的DU，是指经过严格的药物治疗，溃疡症状持续不缓解或反复发作影响患者的日常生活和工作。从病理变化来看，大致相当于慢性穿透溃疡，或位于十二指肠球后的溃疡，或胃泌素瘤、多发内分泌腺瘤等引起的溃疡。从临床特点来看，溃疡疼痛的节律性消失，多变为持续性疼痛，进食和抗溃疡药物不能止痛或发作时间延长等。对于这种难治性溃疡，不能贸然诊断，急于手术治疗，但也不能无限制的继续药物治疗。虽然各医院掌握的标准并不尽相同，但选择手术治疗的具体临床标准大致是：①病史多年，发作频繁，病情越来越重，疼痛难忍，至少经一次严格的内科治疗，未能使症状减轻也不能制止复发，以致影响身体营养状态，不能正常生活和工作；②经X线钡餐检查或胃镜检查，证实溃疡较大，球部严重变形，有穿透到十二指肠壁外或溃疡位于球后部者；③过去有过穿孔或反复大出血，而溃疡仍呈活动性；④胃泌素瘤患者。